《盗墓笔记》的故事线主要围绕着吴邪和他的朋友们展开，是一部充满神秘与冒险的悬疑小说系列。故事从吴邪在长沙古墓中发现一系列诡异事件开始，他与老九门家族的后人张起灵、王胖子等人联手，逐渐揭开了一系列关于青铜门背后的秘密。
最初，吴邪为了寻找失踪的三叔而深入古墓，这一过程中，他不仅遭遇了各种机关陷阱，还发现了张家与汪家之间的恩怨情仇。随着剧情发展，他们得知了一个名为“终极”的地方，据说那里隐藏着解开一切谜团的关键。
随后，吴邪与伙伴们经历了七星鲁王宫、西沙海底墓穴等多处险境，在这些探险中，他们不断挖掘出更多关于古代文明的秘密以及与自己家族相关的线索。特别是在长白山天宫中，吴邪亲眼见证了张起灵牺牲自我封印邪物的过程，这让他对友情有了更深的理解。
整个故事高潮出现在黄山古墓里，这里不仅有惊心动魄的对决，还有关于吴邪身世的重要揭示。最终，吴邪终于找到了失踪多年的三叔，并且意识到自己需要面对未来更大的挑战——守护这个世界的和平。
《盗墓笔记》通过紧凑的情节安排和丰富的人物形象塑造，带领读者经历了一场场惊险刺激的冒险旅程，同时也探讨了人性、信任以及责任等深刻主题。