斯坦福数据科学家表明，计算出一个数字可以帮助他们找到最危险的癌细胞。
斯坦福大学医学院的生物医学数据科学家表明，细胞用于制造 RNA 的基因数量是衡量细胞发育程度的可靠指标，这一发现可以使靶向致癌基因变得更加容易。
引发癌症的细胞被认为是干细胞，它们是很难找到的细胞，它们可以自我繁殖并发育或分化成更特殊的组织，如皮肤或肌肉——或者，当它们变坏时，变成癌症。
“目前，靶向治疗专注于特定基因或分子，其中绝大多数可能不是癌症干细胞特有的，”生物医学数据科学助理教授兼研究所成员 Aaron Newman 博士说。干细胞生物学和再生医学。“通常这些疗法不会持续很长时间。但如果你能识别出分化程度最低的细胞，然后寻找它们特有的标记，那么找到目标基因就不再是一场猜谜游戏了。”
该研究的发现也很重要，因为识别各种组织类型的干细胞是再生受损或功能障碍组织的重要一步。
科学家们表明，随着干细胞变得更加分化并且更像成体细胞，它们表达的基因越来越少。此前，其他研究人员已经注意到这种相关性，并认为这可能是一个有趣的巧合。但 Newman 和他的同事率先对公共数据库中的数千个单细胞基因测试进行了分类，并证明了这种模式是一致且可靠的。
纽曼和医学博士。学生 Gunsagar Gulati 将对细胞中表达的基因数量的测量与对每个基因产生的 RNA 拷贝数量的测量相结合，作为计算机算法 CytoTRACE 的基础，该算法旨在确定细胞的发育程度。
一篇描述这项研究的论文今天在线发表在《科学》杂志上。纽曼是资深作者。Gulati 和该研究所的讲师 Shaheen Sikandar 博士共同担任主要作者。
肿瘤细胞多种多样
癌性肿瘤可能包含数百万个细胞，每个细胞可能有数千个基因突变。肿瘤中的细胞是多种多样的。大多数将是分化的细胞，它们会自行自然死亡，而相对较少的是更危险的癌症干细胞或肿瘤起始细胞。这些细胞很难找到，因此很难使用当前方法进行表征，但使用 CytoTRACE 更容易找到。
“作为一名癌症研究人员，我觉得最令人兴奋的是，这个工具可以帮助我们找到肿瘤起始细胞，这些细胞长期以来一直被认为是导致治疗耐药、转移和治疗后复发的原因，”Sikandar 说。